自107年4月1日起，本校理學院與日本理化學研究所(RIKEN)將雙方之聯合實驗室提升至機構層次，建立「陽明交通大學理學院－理研創發物性科學研究中心聯合研究實驗室」(RIKEN CEMS – COS, NYCU Joint Research Laboratory)，由RIKEN之創發物性科學研究中心(CEMS)編列年度經費1000萬日圓予本校，本校亦提供相對應之經費供該聯合實驗室使用，並聘任RIKEN退休之河野公俊(Kimitoshi Kono)博士全時於本校服務。由日方每年提供1000萬日圓供此聯合實驗室使用，實為臺灣國際合作之創舉。雙方於102年起輪流舉辦「RIKEN-NCTU Symposium on Physical and Chemical Science」雙邊研討會，107及108年分別於日本群馬及臺灣新竹舉辦第六、七屆。109年原訂於日本舉辦第八屆，因疫情影響，延至110年10月以線上模式辦理。第九屆於111年11月採線上及視訊混合方式辦理，RIKEN及中心各推派4位成員演講，共110人與會。
112年2月中心協助本校與RIKEN簽訂校級合作備忘錄，未來雙方將在物理、化學及材料及其他相關領域全面合作，包含人員交流、學生交換、辦理雙邊研討會、共同申請研究計畫等，強化研究交流。同年10月26-27日於日本舉辦第10屆雙邊研討會，我方共7位成員受邀演講，並推派3位博士後研究員、4位博士生及1位碩士生前往發表壁報論文。
107年5月與日本北海道大學電子科學研究所(RIES, Hokkaido University)簽約合作成立「陽明交通大學理學院－北海道大學電子科學研究所共同研究教育中心」(NYCU-RIES Joint Education and Research Center)，於本校基礎科學教學研究大樓414室掛牌，日方亦於北海道大學成立合作辦公室並掛牌。RIES於110年12月聘任中心許千樹、李遠鵬、李耀坤、陳俊太、林俊源及許鈺敏6位教授為其客員教授，我方則於111年8月起聘任RIES居城邦治、中垣俊之、太田裕道、三友秀之、平井健二及片山司6位教授為客座教授。透過雙方合聘教授、交換人員、承認學分、共用儀器與合作研究，進一步深化雙方合作。前期雙方每年定期舉辦雙邊研討會，輪流在本校及北海道大學舉行。106年10月27-28日在本校舉辦第九屆。107年擴大與日本「物質‧元件領域聯盟」合辦，如下方第(3)點所述。108年12月3-4日於日本舉辦第十屆，我方共推派11位成員(含5位博士生)前往發表口頭及壁報論文。109年原訂於本校舉辦第十一屆，因疫情影響，延至110年12月以線上模式辦理。111年12月13-14日於本校舉辦第12屆雙邊研討會，雙方各推派6位成員演講。112年12月7-8日於日本札幌舉辦第13屆雙邊研討會，我方共4位成員受邀演講，並推派2位博士後研究員、4位博士生及1位碩士生前往發表壁報論文。
107年5月18-20日，本中心與日本「物質‧元件聯盟」及中研院應科中心合作辦理第一屆「The First International Joint Symposium of CEFMS-NCTU, RCAS-AS (Taiwan) and 5-Star Alliance (Japan)」(5+2)研討會，日方共派出35位成員(其中包含北海道大學「電子科學研究所」(RIES)、東北大學「多元物質科學研究所」(IMRAM)東京工業大學「生命科學研究所」(CLS)、大阪大學「產業科學研究所」(ISIR)及九州大學「先導物質化學研究所」(IMCE)等5所中心之主任。)前來提供口頭及壁報演講，揭開雙方合作序幕。第二屆5+2研討會於108年11月3-4日於日本東北大學舉辦，我方與應科中心共推派14位成員(含博士後研究員及博士生7位)前往發表口頭及壁報論文，並洽談未來合作事宜。第三屆研討會原訂於109年由中研院應科中心舉辦，後因疫情影響，延至110年11月16-18日以視訊方式辦理，中心共推派5位成員演講。第四屆研討會規劃113年於九州大學舉辦。
- Summer School
自101年起，本中心與增原宏教授合作，每年暑期固定辦理為期三天的Hsinchu Summer School and Workshop，利用其人脈，有系統地邀請國際知名學者授課，內容涵蓋量子粒子、金屬氧化物、DNA、奈米粒子、奈米結構、人工光化學合成、尖端成像、生物探測、鈣鈦礦等。並於最後一天舉行研討會，更深入的討論相關主題的研究結果。107年進一步與日本學術振興會(JSPS)「Nano-Material Optical Manipulation」計畫合作，108年更加入澳洲墨爾本大學ARC Centre of Excellece in Exciton Science一同合作舉辦，108年並首次將此活動列為1學分的國際課程。109-110年因疫情停辦，111年改為線上舉辦，112年第10屆恢復為實體辦理。本次與日本學術振興會(JSPS)「Dynamic Exciton」計畫合作，共邀請9位日本教授以Nano Material Discovery “Dynamic Exciton”為題演講，並安排學生發表壁報論文，全程共117人參加，所開設之1學分的國際課程，共11位同學選修。日方今年推派10位學生參加，與臺灣學生一起討論、交流並建立社群網絡，使年輕一輩早日建立國際聯繫，培養國際觀。
- 國際課程
為深化本中心與日本「物質‧元件聯盟」5校以及中研院應科中心之交流，107年9月到108年1月首次創新開設「創發性材料及元件特論」國際課程，108年持續開設。109到111年因受疫情影響，改為線上直播方式授課。112年9月恢復實體授課。本課程每學年共邀請10-12位日本「物質‧元件聯盟」成員及2位中研院應科中心研究員分別於每週一授課3小時，並搭配課後小考。課程內容深入淺出，從化學、高分子、材料、物理和生物科技等基本概念談起，再進入跨領域之尖端研究與應用，期望能提供學生一系列最具創新性的、跨領域的研究主題。同時透過雙方之交流，可為日後合作建立良好基礎。此課程六年內共有396位同學選修，反應良好。